老鼠身上帶有多種病毒，即使是被老鼠咬傷或抓傷，也可能會導致疾病和發燒。它們的尿液是鉤端螺旋體病蔓延的原因，感染後可能導致肝腎損害，這個病菌也可以通過處理或吸入糞便感染到，並引發其他病症包括腎功能衰竭，肝功能衰竭以及心血管疾病。
老鼠傳播的疾病分為兩類：直接暴露於大鼠感染的糞便，尿液或叮咬而傳播的疾病，以及通過中間節肢動物媒介（如跳蚤，蝨子或蟎蟲）間接傳播給人們的疾病。以下部份疾病在香港並不常見，如黑死病、漢他病毒。
老鼠直接傳播的疾病
淋巴細胞性絨毛膜腦膜炎（LCMV）是一種病毒感染性疾病，可通過大鼠的唾液和尿液傳播。感染後有些人會長期遭受淋巴細胞性脈絡膜腦膜炎的影響，而另一些人只會感到暫時的不適。
漢他病毒肺綜合症 – 傳播方式是吸入被大鼠尿液或糞便污染的粉塵，與大鼠糞便或尿液直接接觸，少部分是因老鼠咬傷而被感染的。
老鼠也是潛在的過敏原來源。老鼠的糞便，皮屑和頭髮脫落會導致人們打噴嚏和別的過敏反應。
老鼠間接傳播的疾病
歷史上最危險的鼠源性疾病之一是鼠疫，又稱“黑死病”。當老鼠的跳蚤咬人時，就會發生轉移。在中世紀，鼠類攜帶的跳蚤被認為是造成瘟疫的主要原因，這場瘟疫殺死了數百萬人。從鼠疫到漢坦病毒的傳播，老鼠的侵擾對人類健康絕對有害。
科羅拉多壁蝨熱病毒 – 這是一種病毒性疾病，通過曾經在老鼠吸血的扁蝨咬傷傳播。
防治鼠患
老鼠的糞便，巢狀材料和死的囓齒動物從家裡移走。防治鼠患有「三不政策」，「不讓鼠來、不讓鼠住、不讓鼠吃」，乾淨的環境衛生是防範鼠患的最佳方法，應特別注意是倉庫、儲藏室等老鼠容易窩藏的空間。
為了避免病毒，必須將所有老鼠的糞便、尿液必須清理。清掃前，可先用漂白水 / 酒精/消毒劑徹底噴灑，以免任何物質懸浮在空氣中，待消毒作用30分鐘後再行清理。清理時使用手套來處理老鼠的屍體或糞便，必須將帶防毒面具的呼吸器與防毒面具一起佩戴。在處理老鼠侵擾時，每個人都應謹慎行事，並聯繫滅蟲公司。
